En tant qu'organisation à but non lucratif, l'Institut est politiquement indépendant malgré sa proximité avec les décideurs politiques. Le Comité de direction de l'Institut est composé de personnalités d'Allemagne et de France. Aux côtés du président ou de la présidente y siègent également des représentants des bailleurs de fonds institutionnels. Le directeur ou la directrice dirige les opérations et est responsable devant le Comité de direction ainsi que devant l'association.